L&T Biowatti aloitti toimintansa vuoden 1994 alussa Metsäliiton tytäryhtiönä. Toiminta perustui alussa mekaanisen metsäteollisuuden sivutuotteiden markkinoiden kehittämiseen. Toinen päätehtävä oli metsäraaka-aineen hankinnan käynnistäminen yhdessä Metsäliiton kanssa.
Vuoden 2005 alusta yhtiö siirtyi kokonaan toimivan johdon omistukseen ja Lassila & Tikanoja Oyj:n tytäryhtiöksi vuoden 2007 alusta. Vuoden 2012 alussa Lassila & Tikanoja lunasti L&T Biowatti Oy:n kokonaisuudessaan omistukseensa.